Bãi Ngự là một trong những địa danh gắn liền với lịch sử đảo Thổ Chu. Tương truyền, trong những năm bôn ba tránh nạn, Nguyễn Ánh từng ghé vào đây trú ẩn. Về sau, khi Nguyễn Ánh lên ngôi vua, người dân địa phương đã gọi khu vực này là Bãi Ngự để ghi nhớ dấu ấn lịch sử ấy.
Cùng với Bãi Dong, Bãi Ngự giữ vai trò quan trọng trong đời sống sinh hoạt và sản xuất của cư dân Thổ Chu. Theo quy luật gió mùa, vào mùa gió Bắc, tàu thuyền thường quay về neo đậu tại Bãi Ngự – nơi có địa hình kín gió, thuận lợi cho sinh hoạt và buôn bán. Khi bước vào mùa gió Nam, tàu cá lại chuyển sang neo tại Bãi Dong, kéo theo sự dịch chuyển linh hoạt của các hoạt động dịch vụ trên đảo.
Bãi Ngự hiện là khu vực dân cư đông đúc và ổn định nhất trên đảo Thổ Chu. Nhà cửa, chợ, quán hàng, dịch vụ ăn uống được hình thành cố định, tạo nên nhịp sống sôi động và thuận tiện cho người dân cũng như tàu thuyền ra vào.
Đáng chú ý, tại Bãi Ngự còn có cảng Bãi Ngự – công trình cảng hậu cần nghề cá được đầu tư quy mô lớn, với tổng vốn khoảng 150 tỷ đồng. Những năm gần đây, cùng với sự phát triển của hạ tầng, lượng du khách từ đất liền ra Thổ Chu ngày càng tăng. Từ đó, các dịch vụ du lịch như nhà nghỉ, quán ăn, quán cà phê, cửa hàng tạp hóa, cơ sở chế biến hải sản… cũng dần hình thành, đưa Bãi Ngự trở thành trung tâm sinh hoạt, giao thương và đón khách du lịch của đảo Thổ Chu.
